维护农民工的合法权益的方法是双方进行协商或者申请企业调解委员会调解，协商和调解都不成的，可以向当地劳动仲裁部门申请仲裁，或者是依法向人民法院起诉。
一、怎么样才能维护农民工的合法权益
按照以下方法才能维护农民工的合法权益：
1. 双方自行协商解决。当事人在自愿的基础上进行协商，达成协议。
2. 调解程序。不愿双方自行协商或达不成协议的，双方可自愿申请企业调解委员会调解，对调解达成的协议自觉履行。调解不成的可申请仲裁。当事人也可直接申请仲裁。
3. 仲裁程序。当事人一方或双方都可以向仲裁委员会申请仲裁。仲裁庭应当先行调解，调解不成的，作出裁决。一方当事人不履行生效的仲裁调解书或裁决书的，另一方当事人可以申请人民法院强制执行。该程序是人民法院处理劳动争议的前置程序，也就是说，人民法院不直接受理没有经过仲裁程序的劳动争议案件。
4. 法院审判程序。当事人对仲裁裁决不服的，可以自收到仲裁裁决书之日起15日内将对方当事人作为被告向人民法院提起诉讼。人民法院按照民事诉讼程序进行审理，实行两审终审制。福尔摩思提示，法院审判程序是劳动争议处理的最终程序。
二、什么条件可以享受农民工法律援助
1.申请事项属于规定的法律援助范围；
2.有充分理由证明为保障自己合法权益确需获得法律援助；
3.因经济困难，无能力或无完全能力支付法律服务费用；
4.住所地在本市或持有本市暂住证。
三、农民工讨薪法律援助怎么申请
1.申请：由申请人向有受理权的法律援助机构递交申请材料。
2.受理：法律援助机构工作人员收到申请人的申请材料，进行登记，出具收到凭证，标明日期。
3.审查：法律援助机构自收到法律援助申请材料之日起三个工作日内进行审查。对疑难复杂的案件，经法律援助机构负责人批准，能够延长三个工作日。
4.补充递交材料：法律援助机构经审查以为申请人递交的申请材料不齐全的，应该一次性告知申请人做出必需的补充或是说明材料。
5.调查核实材料：法律援助机构经审查以为申请人递交的申请材料需要查证的，应该向相关单位进行调查核实。法律援助机构调查核实的时间不计入审查决定期限。
